1、东区繁育室：
面积1700m2，为屏障设施，年饲养大小鼠20余万只，配备有洗笼机、高压灭菌器、垫料收集台、超净工作台、生物安全柜、IVC系统、隔离器等相关设备。
2、东区大小鼠动物实验室：
面积1600m2，配备洗笼机、垫料收集台、超净工作台、生物安全柜、IVC系统等相关设备，可提供笼位1万余笼，保障北大医学大小鼠实验的基本需求。
3、东区大动物实验室：
面积800m2，配备大动物饲养笼具，大动物手术室，实验室配备无影手术灯，动物呼吸机，高频电刀，动物血压计，多道生理记录仪，大动物负压解剖台，大型高温高压灭菌器等相关仪器设备，提供小型猪、羊、犬、兔等的相关技术服务。
4、东区平房大小鼠卫星设施：
面积200m2，配备IVC系统，为实验后动物的暂养提供笼位600个。
5、东区检测室：
面积300m2，提供大、小鼠病毒抗体和寄生虫检测，实验动物血常规检测，实验动物血生化检测等服务。
6、科技楼13层大小鼠动物实验室：
7、科技楼13层无菌动物实验室：
8、科技楼14层大小鼠动物实验室：
9、科技楼15层繁育室：
10、科技楼15层胚胎移植室：
11、生产和使用许可证：
本部现持有北京市科学技术委员会颁发的：
东区老设施
1) 实验动物使用许可证
许可证号：SYXK（京）2021-0064
适用范围：普通环境：豚鼠、地鼠、兔、犬、小型猪、羊
屏障环境：大鼠、小鼠
2) 实验动物生产许可证
许可证号：SCXK(京)2021-0013
适用范围：屏障环境：小鼠、大鼠
医学科技楼新设施
1) 实验动物使用许可证
许可证号：SYXK（京）2022-0037
适用范围：屏障环境：小鼠、大鼠、豚鼠、地鼠
隔离环境：小鼠、大鼠
2) 实验动物生产许可证
许可证号：SCXK(京)2022-0009
适用范围：屏障环境：小鼠、大鼠
隔离环境：小鼠、大鼠
